Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb1P09055 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb1P09055 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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