Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ifna5P07349 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms