Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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