Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01653 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
P01653 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
P01653 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01653 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01653 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01653 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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