Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01650 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
P01650 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
P01650 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01650 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01650 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01650 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms