Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccl20O89093 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccl20O89093 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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