Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

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Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BlmO88700 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BlmO88700 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BlmO88700 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BlmO88700 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms