Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pak1O88643 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pak1O88643 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms