Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lnx1O70263 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms