Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms