Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sdc4O35988 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sdc4O35988 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sdc4O35988 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms