Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.5 ms