Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited2O35740 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms