Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stag2O35638 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms