Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms