Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms