Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3278L7N2D2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms