Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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