Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smim18J3QNP2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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