Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3415J3QMS8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Gm3415J3QMS8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm3415J3QMS8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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