Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm20828J3KMI7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm20828J3KMI7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm20828J3KMI7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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