Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Taf4bG5E8Z2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms