Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp17lcG5E8I7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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