Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sclt1G5E861 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms