Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms