Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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