Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm5861F6VCN9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5861F6VCN9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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