Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf212F6TQD1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf212F6TQD1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Rnf212F6TQD1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rnf212F6TQD1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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