Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms