Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms