Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms