Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms