Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms