Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brd1E9PZ26 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms