Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc8E9PWG2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms