Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3252E9PUT9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms