Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3bE9PUL3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms