Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc170D3YXL0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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