Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Gm20547B8JJN0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Gm20547B8JJN0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20547B8JJN0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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