Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms