Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NhsB1AV60 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NhsB1AV60 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms