Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trabd2bB1ATG9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trabd2bB1ATG9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trabd2bB1ATG9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Trabd2bB1ATG9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Trabd2bB1ATG9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Trabd2bB1ATG9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trabd2bB1ATG9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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