Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms