Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms