Protein–RNA interactions for Protein: A2ALC6

Gm4985, MCG8129, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4985A2ALC6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm4985A2ALC6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4985A2ALC6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms