Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Frmpd1A2AKB4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frmpd1A2AKB4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms