Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Frmpd4A2AFR3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Frmpd4A2AFR3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms