Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc1lA2A5N3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc1lA2A5N3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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