Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms