Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3550W4VSN7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms